As unidades navais são embarcações que exigem uma maior capacidade tecnológica, uma vez que contêm complexos sistemas electrónicos e de armamento. As principais unidades construídas pela SIMA são fragatas de mísseis de 2400 toneladas de deslocamento, equipadas com mísseis de longo alcance, e barcos de patrulha Coast-Guard. Actualmente, estas embarcações constituem a frota da Marinha peruana e são uma amostra do elevado nível tecnológico alcançado pelo SIMA.
No âmbito das exigências de defesa e segurança contra acções ilegais de contrabando, tráfico de droga ou terrorismo, o SIMA desenvolve igualmente navios rápidos totalmente equipados para diferentes condições geográficas, tais como embarcações costeiras, embarcações de canoagem fluvial e lanchas rápidas para apoio logístico.
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